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bac质粒提取_bac质粒提取可以冻存菌体吗
2024-10-31 16:29:16 50人已围观
简介1.E.coli DH10 Bac与DH5α有什么区别2.染色体和质粒都可以作为基因工程的载体么3.什么是BAC序列?4.什么是细菌人工染色体?5.质粒DNA琼脂糖凝胶电泳图该怎么分析因为高拷贝质粒稳定性低,而且给宿主细胞的压力大。 低拷贝数的质粒DNA在宿主细胞分裂前只能复制1~2次,而多拷贝数质
1.E.coli DH10 Bac与DH5α有什么区别
2.染色体和质粒都可以作为基因工程的载体么
3.什么是BAC序列?
4.什么是细菌人工染色体?
5.质粒DNA琼脂糖凝胶电泳图该怎么分析
因为高拷贝质粒稳定性低,而且给宿主细胞的压力大。
低拷贝数的质粒DNA在宿主细胞分裂前只能复制1~2次,而多拷贝数质粒可以在细胞分裂前复制成10~200拷贝。
高拷贝数的质粒称为松弛型质粒(relaxed plasmid),独立于细菌细胞而自主复制;低拷贝数的质粒一般是严紧型质粒(stringent plasmid),它们的复制随细菌染色体的复制同步进行。
一般来说,外源基因的表达量随拷贝数的增加而提高,但是当拷贝数很大时,拷贝数与发酵目标产物产率的这种关系却不存在。这主要有两方面的原因:一方面,高拷贝数时外源基因的表达量不再由质粒的拷贝数决定,可能是由转录和翻译水平决定的;另一方面,高拷贝数的质粒往往很不稳定。由于质粒拷贝数的变化直接与基因目标产物的产率有关,因此对于重组蛋白的生产来说,质粒的拷贝数是一个非常重要的参数。
而且同一个细胞里一般不会同时有两种不同的质粒,这是质粒不相容性(plasmid incompatibility)。在细菌细胞增殖过程中,其中必有一种会被逐渐排斥。所以要用纯化过的低拷贝质粒。
低拷贝在鸟枪法测序中很常用的。
随机测序战略又称鸟枪战略(shotgun strategy),此策略是将人 类基因组DNA用机械方法随机切割成2Kb左右的小片段,把这些DNA片段装入适当载体,建 立亚克隆文库,从中随机挑 取克隆片段.最后通过克隆片段的重叠组装确定大片段DNA序列.?
1991年,Hunkapiller T等首先应用鸟枪策略分析了小鼠T细胞受体和靶位的94.6kb基因组. 19 95年,美国私立基因组研究所(TIGR)所长Venter JC率先应用鸟枪策略对微生物基因组测 序 并取得了成功.同年完成的流感嗜血杆菌的序列测定完全是用shotgun策略直接进行的.该实验充分证明了此策略是分析微 生物基因组全序列的有效策略之一.从1998年起,Venter领导的研究小组对人类全基因组用鸟枪 战 略测序DNA提出大胆构想,在三个层次上进行测序,即对每一层次克隆的两端的称为序 列标签联结子(STC)的500bp进行测序.第一个层次用BAC做载体,插入片段为150kb,并 构建30万个BAC克隆,对每个BAC两端的500bp直接测序,获得10%的人类基因组序列,平均每 5kb就有一个500bp序列标记.第二层次是用低拷贝质粒作载体,插入10kb片段,构建500万 个克隆,对克隆两端的500bp测序,得到50亿个碱基序列.第三层次是用多拷贝质粒作载体 ,插入2kb片段,构建3000万个克隆,再对每个克隆的500个碱基直接测序,可获得300 亿个碱基序列
E.coli DH10 Bac与DH5α有什么区别
生化书里说的 “每个细胞只有一个或少数几个拷贝”是指的:在同一个细胞内有几个完全相同质粒同时存在的数量,而不是复制多少次。
我想你输错了,松弛控制的质粒,每个细胞可以有几十直到几百个拷贝,也就是说,同一个细胞内,有完全相同的质粒几十直到几百个。现在基因工程里常用的大肠杆菌质粒如pUC19等就属于这一类。
严谨型的质粒,才只有一个或少数几个拷,比如大肠杆菌的F质粒,在人类基因组中用得很多的BAC质粒就属于这一类质粒。
严谨型的质粒的复制,受基因组的复制的调控。而松弛型的质粒不受其调控,也就是在细胞不分裂时,松驰型的质粒还会继续复制,而严谨型的则一般会停止。
在适当的宿主细胞内,质粒总是会随着细胞一直不停的复制下去的,所以质粒的复制能力是无限的,因此,生化书里说的是指的在一个细胞内有几个拷贝数,而不是复制多少次。
染色体和质粒都可以作为基因工程的载体么
DH5α是最最常用的质粒克隆的菌株。
DH5α在使用pUC系列质粒载体转化时,可与载体编码的β-半乳糖苷酶氨基端实现α-互补。可用于蓝白斑筛选鉴别重组菌株。
菌株中很多重组酶、修饰酶等缺失,防止质粒的重组、修饰,能够保持携带质粒的稳定性。
本底蛋白表达较低,便于提取高纯度质粒。
一般常用于质粒的构建、扩增,较少用于蛋白表达。
DH10 Bac是一种比较特殊的感受态细胞,在昆虫-杆状真核表达系统专门用于生产重组杆状。细胞内含有Bacmid和质粒。
连有目的基因的pfastBac系列载体转入细胞后,会在helper的帮助下与Bacmid发生重组,产生重组杆状,提取出来后可直接用于昆虫细胞的转染。生产目的蛋白。
什么是BAC序列?
都可以的,质粒就不用说了,是基因工程最常用的载体,而某些细菌、酵母菌的染色体的部分结构单元也可改造成“人工酵母染色体(YAC)”\“人工细菌染色体(BAC)”,比质粒具有更大的包装容量。
以下资料供参考:
人工染色体(英文:artificial chromosome)指人工构建的含有天然染色体基本功能单位的载体系统。包括酵母人工染色体(YAC)、细菌人工染色体(BAC)、P1派生人工染色体(PAC)、哺乳动物人工染色体(MAC)和人类游离人工染色体(HAEC)。人工染色体为基因组图谱制作、基因分离以及基因组序列分析提供了有用的工具。
什么是细菌人工染色体?
中文名称:细菌人工染色体
英文名称:bacterial artificial chromosome;
BAC 定义:利用大肠杆菌F质粒或P1噬菌体为基础构建的用于在大肠杆菌中克隆大片段DNA(100~300 kb)的载体。用于基因组结构的分析。
质粒DNA琼脂糖凝胶电泳图该怎么分析
细菌人工染色体是基于大肠杆菌的F质粒构建的、高通量低拷贝的质粒载体,每个环状DNA分子中携带一个抗生素抗性标记、一个来源于大肠杆菌F因子(致育因子)的严谨型控制的复制子emphasis:role=italicoriSemphasis、一个易于DNA复制的由ATP驱动的解旋酶(RepE)以及三个确保低拷贝质粒精确分配至子代细胞的基因座(emphasis:role=italic、parB和parCemphasis)(link:xlinkhref=i011402图4-15link)。
BAC载体的低拷贝性可以避免嵌合体的产生,减小外源基因的表达产物对宿主细胞的毒副作用。BAC载体空载时大小约7.5kb,在大肠杆菌中以质粒的形式复制,具有一个氯霉素抗性基因(CMsuperscriptksuperscript)。外源基因组DNA片段可以通过酶切、连接克隆到BAC载体多克隆位点上,通过电穿孔的方法将连接产物导入大肠杆菌重组缺陷型菌株。
装载外源DNA后的重组质粒通过氯霉素抗性和emphasis:role=italicLac:Zemphasis基因的α-互补筛选。BAC与YAC和PAC(P1:artificial:chromosomes,P1人工染色体)相似,没有包装限制,可接受的基因组DNA大小也没有固定的限制。大多数BAC文库中克隆的平均大小约120kb,然而个别的BAC重组子中含有的基因组DNA最大可达300kb。
这个问题太宽泛了吧?到底是想问什么?最左边那一道我默认是核酸marker,那么右边四条道都是你的目标样品,首先可以看大小,你的四个样品的目标带都一致,且分子量肯定是比 marker最上面那条还大,然后看纯度,你的四个样品都比较干净,没有杂带,没有降解!虽然你没有写marker的货号 不知道每条带的分子量,但从你0.8%的浓度看,你的样品应该是BAC之类的吧?做的基因重组?或者本来就是提的基因组DNA?